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Ecole RéNaFoBiS Oléron juin 2014

Programme et supports de cours

Groupe-Oléron-2014

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Dimanche 1er Juin

20h45  Introduction et présentation générale.  Jean Cavarelli

21h : Conférence  inaugurale: Des structures 3D à  la biologie structurale intégrative : Quelles étaient les questions hier, quelles sont-­elles aujourd’hui, quelles seront-­elles demain ? Quels outils pour y répondre ?  - Dino Moras

 Lundi 2 Juin

Matin : Apports et limites des diverses méthodes de biologie structurale

  9h: Le rôle des mouvements de domaines dans une réductase à diflavine  : un regard de la biologie structurale intégrative (RX/RMN/SAXS et autres) - Ewen Lescop

10h:45  La protéine HIV-­intégrase : approches structurales combinées par biologie moléculaire, cristallographie, microscopie électronique et fluorescence - Marc Ruff

Après-­midi : Technologies – Etat des lieux et développements

14h : Synchrotron et détecteurs de rayons X - Andrew Thompson

15h : Cryo-microscopie électronique - Bruno Klaholz

16h30 : Etats des lieux et développement en RMN - Bruno Kieffer

 Mardi 3 Juin

Matin : Diffraction et diffusion – Aspects conceptuels

9h : Principles of X-ray scattering by macromolécules - Dominique Housset

9h45: Practical aspects of Macromolecular X-ray crystallography - Jean-Luc Ferrer (lien vers le film du robot de pêche des cristaux)

10h45: Basis of the Small Angles X-rays Scattering method - Pierre Roblin

11h30: SAXS versus Cristallographie: informations et limites comparées - Marie-Hélène Le DU

Après-­midi : Diffraction et diffusion – Aspects pratiques

14h-17h : TP / TD / Etudes de cas - Marie-Hélène Le Du / Pierre Roblin / Dominique Housset / Jean-Luc Ferrer

Combinaison et complémentarité SAXS et cristallographie : le cas d'un complexe téléférique, Rap1, et de l'amylosucrase (Traitement des données Rap1,  Remplacement moléculaire du complexe Rap1/ADN,  Reconstruction boucle 565-602 Rap1, Etude de deux amylosucrase par SAXS et cristallographie : Monomère versus dimère

21h : Conférence invitée: XFEL, nanocristallographie aux rayons X et molécule unique - Jacques-Philippe Colletier

 Mercredi 4 Juin

Matin : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects conceptuels

9h : Les observables RMN: Une source d’informations structurales et dynamiques pour les biomacromolécules - Catherine Bougault

10h45 : Contributions de la RMN à la biologie structurale: Approches multi‐échelles spatiales et temporelles - Carine van Heijenoort

Après-­midi : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects pratiques

14h-17h : TP / TD / Etudes de cas - Ewen Lescop / Bruno Kieffer / Carine van Heijenoort / Catherine Bougault

Le spectre HSQC pour la caractérisation rapide et simple de la structure/dynamique de biomacromolécules

21h : Conférence invitée: D'une description structurale statique de la paroi bactérienne à une vision dynamique de ses mécanismes d'assemblage : les apports de la RMN - Catherine Bougault

 Jeudi 5 Juin

Matin : Microscopie électronique – Aspects conceptuels

9h: Que peut-­on voir avec un microscope électronique à transmission ? - Pierre‐Damien Coureux

9h45 : Préparation des échantillons biologiques pour des études structurales en cryo-microscopie électronique - Jean-François Ménétret

10h30 :  Traitement d'images 2D pour l'analyse des assemblages macromléculaires - Pierre‐Damien Coureux

11h15 :  Traitement d'images et reconstruction 3D  - Jean-François Ménétret

Après-­midi : Microscopie électronique – Aspects pratiques

14h-17h : TP / TD / Etudes de cas - Pierre-Damien Coureux / Jean-François Ménétret

Cryo-microscopie : ajustement des cartes, reconstruction

 Vendredi 6 Juin

Matin : Approches complémentaires

9h : Approches complémentaires pour l'analyse des interactions moléculaires. Illustrations sur plusieurs systèmes biologiques - Alain Roussel

10h45 : Méthodes d’imageries biologiques par microscopie à force atomique et optique - Frédéric Eghiaian

Après-­midi : Travail Bibliographique : présentations orales et discussions 

14h-17h45 : Présentation des analyses d'articles - Tuteurs de l'école RéNaFoBIS

17H45 :  Conclusion et Bilan.