Formation Pratique RMN GiGrIll

Présentation générale

Cette formation est organisée conjointement par le Laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire (IBS, Grenoble), le Laboratoire de Biologie et Chimie Structurales (ICSN, Gif-sur-Yvette) et le Laboratoire Structure et Dynamique des polymères biologiques par Résonance Magnétique Nucléaire (IGBMC Strasbourg). Cette formation concerne les différentes étapes d’études de protéines par RMN dans l’objectif d’en comprendre les interactions avec des partenaires biologiques. Elle a lieu chaque année avec des thématiques et des localisations différentes : "Marquage isotopique de protéines pour la RMN" (Strasbourg, 2013, 2016), "Détermination de la structure des protéines par RMN" (Grenoble, 2010, 2012) et "RMN et Interactions Biologiques : Formation pratique avancée" (Gif-sur-Yvette, 2009, 2011, 2014, 2017). La prochaine session aura lieu à Gif-sur-Yvette du 25 au 29 mai 2020 et traitera donc de la "RMN et Interactions Biologiques : Formation pratique avancée".

La cible est les jeunes étudiants en thèse, la formation permanente ainsi que les industriels. Nous souhaitons ainsi diffuser les dernières techniques de pointe en RMN des protéines dans les laboratoires ainsi que fournir aux étudiants les outils les mieux adaptés à leurs projets de recherche.

La formation tient son nom Gigrill des villes (GIf-GRenoble-Illkirch) impliquées dans l'organisation.

Formation avancée FRISBI 2021: RMN et Interactions Biologiques

La session 2021 aura eu lieu en 2 parties, d’abord en distanciel du 10 au 12 mai, puis sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette du 19 au 21 mai 2021. La thématique sera "RMN et Interactions Biologiques : Formation pratique avancée". Compte du contexte sanitaire lié à la Covid, la première partie (lundi 10 au mercredi 12 mai) aura lieu en distanciel et comportera des cours formels et des travaux dirigés. La seconde partie (mercredi 19 au vendredi 21 mai) aura lieu en présentiel. Mais en cas de restriction généralisée de déplacement (confinement global en France), cette partie aura lieu sous forme de tutoriels et de TD dispensés en distanciel. L’objectif de cette formation sera de fournir aux participants les outils nécessaires à l’étude des interactions biologiques impliquant des protéines par RMN du liquide.

Au programme :

- Rappel sur les stratégies de marquage et d'attribution des résonances RMN

- Principes généraux sur la dynamique des protéines et des interactions protéines/ligands (régimes d’échange et phénomènes dynamiques) et stratégie d’étude à adopter,

- l’interaction vue du côté de la protéine (titrage suivi par 15N HSQC...),

- l’interaction vue du côté du ligand dans le cas d’interaction de faible affinité (STD, NOE transféré...),

- outils spectroscopiques et informatiques permettant de reconstruire la structure du complexe,

- Simulations des phénomènes dynamiques en RMN,

- Exemples d’études issus des laboratoires organisateurs.

L’accent sera mis sur les aspects pratiques, sur ordinateur et au spectromètre RMN.

Coût-Inscriptions

Le coût est fixé à 150 euros pour un participant académique et 2500 euros pour un participant industriel. Le coût de l’inscription couvre les repas et l’hébergement sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette pour ceux qui resteront sur site. Des chambres ont été réservées pour la formation. Vous pouvez vous inscrire à l'adresse : https://www.azur-colloque.fr/DR04/inscription/preinscription/161. Renseignements : Christina Sizun (christina.sizun_at_cnrs.fr) et Ewen Lescop (ewen.lescop_at_cnrs.fr).

Organisation

IBS : Catherine Bougault, Jérôme Boisbouvier

ICSN : François Bontems, Carine van Heijenoort, Ewen Lescop, Christina Sizun, Nelly Morellet, Nadine Assrir, François Giraud

IGBMC : Bruno Kieffer, Yves Nominé, Célia Deville

ENS: Guillaume Bouvignies

Programme Prévisionnel

Programme Gigrill 2021

Avec le soutien de FRISBI et IR-RMN-THC

logo IR-RMN logo IR-RMN

Session 2019: AILM Practical school on Advanced Isotopic Labeling for NMR

The practical School is organized in Grenoble just after AIML2019 conference, from March 29th to April 5th 2019. The training will be primarily based on practical sessions in which challenging biological systems are produced and labelled. Systems such as large multi-domain proteins, large monomeric proteins, oligomeric protein assemblies, and large RNAs will be used as well as RNA and protein constructs brought by the participants. Practical sessions will be linked to theoretical classes, and discussion sessions will be organized to promote exchange between participants and instructors. All labelled samples produced by the trainees will be characterized on the IBS high-field NMR platform.
  • Session 2019: AILM Practical school on Advanced Isotopic Labeling for NMR
  • 2019-03-29T13:30:00+01:00
  • 2019-04-05T13:30:00+02:00
  • The practical School is organized in Grenoble just after AIML2019 conference, from March 29th to April 5th 2019. The training will be primarily based on practical sessions in which challenging biological systems are produced and labelled. Systems such as large multi-domain proteins, large monomeric proteins, oligomeric protein assemblies, and large RNAs will be used as well as RNA and protein constructs brought by the participants. Practical sessions will be linked to theoretical classes, and discussion sessions will be organized to promote exchange between participants and instructors. All labelled samples produced by the trainees will be characterized on the IBS high-field NMR platform.
  • Quand ? Du 29/03/2019 13:30 au 05/04/2019 13:30 (Europe/Paris / UTC100)
  • Où ? Institut de Biologie Structurale, Grenoble
  • Nom du contact Dr Jérôme boisbouvier
  • Téléphone du contact jerome.boisbouvier@ibs.fr
  • Participants 16 participants
  • Site Internet Visitez le site Internet
  • Ajouter l'événement au calendrier iCal

The sessions will cover the following isotopic labeling methods: 

-Adaptation, optimization and large scale production of protein in E. coli grown in perdeuterated media

-Methyl specific labelling of large proteins 

-Cell-free expression and specific labelling of soluble and membrane proteins

-Isotopic labeling of protein produced in eukaryotic cells

-Backbone specific labelling and unlabelling

-In vitro production of specifically labelled RNA 

-Cost effective strategies for in vivo production of uniformally labelled RNA 

-Segmental labelling of proteins & RNAs

Session 2018: Détermination de la Structure des protéines par RMN

Le groupe de RMN biomoléculaire de l’IBS (Grenoble), le Laboratoire de Chimie et de Biologie Structurales de l’ICSN (Gif-sur-Yvette) et l’équipe de Structure et Dynamique des polymères biologiques par Résonance Magnétique Nucléaire de l’IGBMC (Strasbourg) organisent une formation pratique avancée intitulée "Détermination de la Structure des protéines par RMN". Cette formation aura lieu à Grenoble du 23 au 27 avril 2018.

L’atelier détermination de la structure des protéines par RMN fournira aux participants les outils modernes nécessaires à l’étude structurale des protéines par RMN du liquide. L’accent sera mis sur l’aspect pratique au spectromètre et devant des stations de travail.

Avec le soutien de l'IR RMN THC, NMR-Bio, Frisbi, SFB, Gral,

Plus de détails ici.

Session 2017: RMN et Interactions Biologiques

La session 2017 aura eu lieu à Gif-sur-Yvette du 3 au 7 avril 2017 avec comme thématique "RMN et Interactions Biologiques : Formation pratique avancée". L’objectif de cette formation sera de fournir aux participants les outils nécessaires à l’étude des interactions biologiques impliquant des protéines par RMN du liquide.

Au programme :

- principes généraux des interactions protéines/ligands (régimes d’échange et phénomènes dynamiques) et stratégie d’étude à adopter,

- l’interaction vue du côté de la protéine (titrage suivi par 15N HSQC...),

- l’interaction vue du côté du ligand dans le cas d’interaction de faible affinité (STD, NOE transféré...),

- outils spectroscopiques et informatiques permettant de reconstruire la structure du complexe,

- exemples d’études issus des laboratoires organisateurs.

L’accent sera mis sur les aspects pratiques au spectromètre (8h) et devant station de travail (11h). Le début et la fin de journée sont dédiés à des cours (15h) plus formels. La présence sur place durant toute la formation est demandée.

Coût-Inscriptions

A déterminer en fonction des demandes de financement en cours. Veuillez d'ores et déjà envoyer un mail de pré-inscription (sans engagement) à gigre_at_icsn.cnrs-gif.fr pour manifester votre intérêt.

Organisation

IBS : Beate Bersch, Jérôme Boisbouvier, Catherine Bougault, Bernhard Brutscher, Pierre Gans, Dominique Marion, Adrien Favier, Jean-Pierre Simorre

ICSN : François Bontems, Eric Guittet, Carine van Heijenoort, Ewen Lescop, Christina Sizun, Nelly Morellet, Nadine Assrir

IGBMC : Bruno Kieffer, Yves Nominé

Programme indicatif

Avec le soutien de: Frisbi, IR-RMN-THC

 

          

 

Session 2015: Détermination de la Structure des protéines par RMN

Le groupe de RMN biomoléculaire de l’IBS (Grenoble), le Laboratoire de Chimie et de Biologie Structurales de l’ICSN (Gif-sur-Yvette) et l’équipe de Structure et Dynamique des polymères biologiques par Résonance Magnétique Nucléaire de l’IGBMC (Strasbourg) organisent une formation pratique avancée intitulée "Détermination de la Structure des protéines par RMN". Cette formation a eu lieu à Grenoble du 18 au 22 Mai 2015.

L’atelier détermination de la structure des protéines par RMN fournira aux participants les outils modernes nécessaires à l’étude structurale des protéines par RMN du liquide. L’accent sera mis sur l’aspect pratique au spectromètre et devant des stations de travail.

Programme de la session 2015

Avec le soutien de l'IR RMN THC, NMR-Bio, Frisbi, SFB, Gral, Bruker Biospin

Plus de détails ici.

Session 2016: Marquage isotopique de protéines pour la RMN

Cette formation aura eu lieu dans les locaux de l'ESBS à Strasbourg du 25 au 29 avril 2016. Elle s'intègre dans un ensemble de formations pratiques sur la RMN biomoléculaire proposées par les laboratoires de Grenoble et Gif-sur-Yvette depuis 2009.

Basée essentiellement sur des ateliers pratiques, la formation vise à donner une première expérience pratique de la production de protéines marquées en vue d’études structurales et/ou d’interaction par RMN. La participation à cette école permettra aux stagiaires d’aborder différentes situations qui peuvent se présenter lors des phases initiales d’une étude de protéine par RMN comme l’absence de sur-expression en milieux marqués, l’agrégation ou encore le repliement incomplet ou incorrect de la protéine. L’objectif principal de cette formation est de fournir une approche rationnelle pour explorer de façon efficace l’ensemble des solutions permettant la réalisation d’un projet d’étude structurale et fonctionnelle en fonction des spécificités des protéines étudiées. La formation est organisée de façon à  favoriser les échanges d’expérience entre l’encadrement et les stagiaires, en alternant des sessions de travail individuel avec des réunions d’analyse et par l’utilisation d’un site web regroupant l’ensemble des informations nécessaires aux différents ateliers.

Cette formation concerne les chercheurs, ingénieurs, et post-doctorants qui auront besoin de ces techniques au cours de leurs travaux mais également les étudiants en thèse qui s'engagent dans un sujet impliquant des marquages isotopiques.

Les inscriptions et programme détaillé sont présents sur le site http://www.gigrill.fr/


Session 2014: RMN et Interactions Biologiques

La session 2014 a eu lieu à Gif-sur-Yvette du 12 au 16 mai 2014 avec comme thématique "RMN et Interactions Biologiques : Formation pratique avancée". L’objectif de cette formation était de fournir aux participants les outils nécessaires à l’étude des interactions biologiques impliquant des protéines par RMN du liquide.

Au programme :

- principes généraux des interactions protéines/ligands (régimes d’échange et phénomènes dynamiques) et stratégie d’étude à adopter,

- l’interaction vue du côté de la protéine (titrage suivi par 15N HSQC...),

- l’interaction vue du côté du ligand dans le cas d’interaction de faible affinité (STD, NOE transféré...),

- outils spectroscopiques et informatiques permettant de reconstruire la structure du complexe,

- exemples d’études issus des laboratoires organisateurs.

L’accent sera mis sur les aspects pratiques au spectromètre (8h) et devant station de travail (11h). Le début et la fin de journée sont dédiés à des cours (15h) plus formels. La présence sur place durant toute la formation est demandée.

Coût-Inscriptions

Coûts :
- étudiants et post-doctorants : gratuit mais logement obligatoire sur place au tarif CNRS (55 euros/nuit en chambre double).
- autres : 1800 euros (possibilité de prise en charge par la formation permanente du demandeur, logement inclus).

Organisation

IBS : Beate Bersch, Jérôme Boisbouvier, Catherine Bougault, Bernhard Brutscher, Pierre Gans, Dominique Marion, Adrien Favier, Jean-Pierre Simorre

ICSN : François Bontems, Eric Guittet, Carine van Heijenoort, Ewen Lescop, Christina Sizun, Nelly Morellet, Nadine Assrir

IGBMC : Bruno Kieffer

Programme de la session 2014

Avec le soutien de l'IR RMN THC

 

Session 2013: Marquage isotopique de protéines pour la RMN

Cette formation a eu lieu dans les locaux de l'ESBS du 10 au 14 Juin 2013. Elle s'intègre dans un ensemble de formations pratiques sur la RMN biomoléculaire proposées par les laboratoires de Grenoble et Gif-sur-Yvette depuis 2009.

Basée essentiellement sur des ateliers pratiques, la formation vise à donner une première expérience pratique de la production de protéines marquées en vue d’études structurales et/ou d’interaction par RMN. La participation à cette école permettra aux stagiaires d’aborder différentes situations qui peuvent se présenter lors des phases initiales d’une étude de protéine par RMN comme l’absence de sur-expression en milieux marqués, l’agrégation ou encore le repliement incomplet ou incorrect de la protéine. L’objectif principal de cette formation est de fournir une approche rationnelle pour explorer de façon efficace l’ensemble des solutions permettant la réalisation d’un projet d’étude structurale et fonctionnelle en fonction des spécificités des protéines étudiées. La formation est organisée de façon à  favoriser les échanges d’expérience entre l’encadrement et les stagiaires, en alternant des sessions de travail individuel avec des réunions d’analyse et par l’utilisation d’un site web regroupant l’ensemble des informations nécessaires aux différents ateliers.

Cette formation concerne les chercheurs, ingénieurs, et post-doctorants qui auront besoin de ces techniques au cours de leurs travaux mais également les étudiants en thèse qui s'engagent dans un sujet impliquant des marquages isotopiques. Cette formation financée par le CNRS dans le cadre des Actions Nationales de Formation sera gratuite (hébergement compris) pour tous les  ingénieurs, chercheurs, enseignant-chercheurs et étudiants appartenant à une unité ayant le CNRS comme (co-)tutelle.

Programme de la session 2013

Avec le soutien du CNRS (ANGD)

Plus d'informations ici: http://gigrestr.u-strasbg.fr/index.php

Programme Gigrill 2013

application/pdf programme.pdf — 69.9 KB

Programme Gigrill 2014

Programme Gigrill 2015

Atelier pratique marquage isotopique des protéines pour la RMN

Cet atelier permet d’aborder de façon pratique les méthodes classiques pour produire des protéines enrichies en isotopes stables (15N et 13C) utilisés pour les études de structure, de dynamique et d’interactions par RMN. Des ouvertures seront également fournies sur les techniques de marquage dans des systèmes eucaryotes ou acellulaires (cell-free). 

Formation pratique RMN GiGrIll: Détermination de la Structure de protéines par RMN

  • Quand ? Du 23/04/2018 07:00 au 27/04/2018 14:00 (CET / UTC200)
  • Où ? IBS, Grenoble
  • Nom du contact
  • Site Internet Visitez le site Internet
  • Ajouter l'événement au calendrier iCal

Le groupe de RMN biomoléculaire de l’IBS (Grenoble), le Laboratoire de Chimie et de Biologie Structurales de l’ICSN (Gif-sur-Yvette) et l’équipe de Structure et Dynamique des polymères biologiques par Résonance Magnétique Nucléaire de l’IGBMC (Strasbourg) organisent une formation pratique avancée intitulée "Détermination de la Structure des protéines par RMN". Cette formation aura lieu à Grenoble du 23 au 27 avril 2018.

L’atelier détermination de la structure des protéines par RMN fournira aux participants les outils modernes nécessaires à l’étude structurale des protéines par RMN du liquide. L’accent sera mis sur l’aspect pratique au spectromètre et devant des stations de travail.

Avec le soutien de l'IR RMN THC, NMR-Bio, Frisbi, SFB, Gral,

Plus de détails ici.

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