Programme
Vendredi 20 mai
17h30 : Bus depuis la gare de La Rochelle Ville (Trajet 1h15 vers La vieille Perrotine)
19h30 : Repas
20h45 : Introduction et présentation générale - Jean Cavarelli
21h : Présentation des étudiants et des formateurs (Une diapo par personne : mon profil, mes questions biologiques)
Samedi 21 mai
Matin : Fondammentaux
9h00 : Préparation et caractérisation des échantillons biologiques en vue d’études structurales - Marc Ruff
10h30 : Pause
10h45 : Principes physiques à la base de l'information structurale - Dominique Housset & Jean Cavarelli
12h30 : Déjeuner
Après-midi : Technologies – Etat des lieux et développements
13h45 : Vérification de l’installation des programmes.
14h15 : Initiation à Linux - Laurent Maveyraud
14h45 : Cryo-microscopie électronique - Bruno Klaholz
15h45 : Pause
16h15 : Sources et détecteurs X - Stéphane Réty
17h15 : Etats des lieux et développement en RMN - Bruno Kieffer & Marie Renault
18h15 : Présentation des infrastructures en biologie structurale. Jean Cavarelli
19h30 : Dîner
21h00 : Study of the type VI secretion system : an example of an integrated structural biology approach - Alain Roussel
Dimanche 22 mai
Matin : Microscopie électronique – Aspects conceptuels
9h00: Que peut-on voir avec un microscope électronique à transmission ? - Pierre-Damien Coureux
10h00 : Préparation des échantillons biologiques pour des études structurales en cryo-microscopie électronique - Olivier Lambert
11h00 : Pause
11h30 : Traitement d'images 2D et 3D pour l'analyse des assemblages macromoléculaires - Bruno Klaholz
12h45 : Déjeuner
Après-midi : Microscopie électronique – Aspects pratiques
14h00 : TP / TD / Etude de cas
16h00 : Pause
16h15 : TP / TD / Etude de cas (suite)
18h00-18h15 Présentation sponsor : Gatan - Vincent Richard
19h30 : Dîner
21h: Journal Club Cryo-EM
Lundi 23 mai
Matin : Diffraction et diffusion des rayons X – Aspects conceptuels
9h00 : Principes de la diffraction des rayons X par les macromolécules - Laurent Maveyraud
10h00: Aspects pratiques de la cristallographie aux rayons X des macromolécules - Stéphane Réty
11h00 : Pause
11h:30 Bases + comparaison de la diffusion des rayons X aux petits angles - Mirjam Czjzek
12h45 : Déjeuner
Après-midi : Diffraction et diffusion des rayons X– Aspects pratiques
14h00 : Présentation sponsor : JEOL- Gilles Thibault
14h15 : TP / TD / Etude de cas
16h00 : Pause
16h15 : TP / TD / Etude de cas (suite)
19h30 : Dîner
21h00: TP SAXS - Aurélien Thureau & Mirjam Czjzek
Mardi 24 mai
Matin : Approches complémentaires
9h00 : Approches complémentaires pour l'analyse des interactions moléculaires. Illustrations sur plusieurs systèmes biologiques - Alain Roussel
10h30 : Pause
10h45 : Relations structures fonctions des complexes participant à l’intégration du génome du VIH-1 dans le génome de la cellule cible - Marc Ruff
12h15 : Présentation sponsor : Pall-FortéBio - Attila Aranyos
12h45 : Déjeuner
Après-midi: libre
19h30: Dîner - paëlla
21h00 : Topoisomérases de type II: éudes structurales d’une famille de nanomachines flexibles - Claudine Mayer
Mercredi 25 mai
Matin : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects conceptuels
9h00 : Les observables RMN: Une source d’informations structurales et dynamiques pour les biomacromolécules - Carine van Heijenoort
10h00 : Contributions de la RMN à la biologie structurale: Approches multi‐échelles spatiales et temporelles – Nathalie Sibille
11h00 : Pause
11h30 : Introduction to biomolecular solid-state NMR spectroscopy - Marie Renault
12h45 : Déjeuner
Après midi : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects pratiques
14h00 Présentation sponsor : Bruker - Séverine Freisz
14h15 : TP Etudes de cas de RMN en phase liquide: Le spectre 15N HSQC pour la caractérisation rapide et simple de la structure/dynamique de biomacromolécules
16h00 : Pause
16h15 : TP Etudes de cas de RMN en phase liquide (suite)
19h30 : Dîner
21h00 : TP Etude de cas en RMN du solide
Jeudi 26 mai
Matin : Approches complémentaires
9h00 : RMN et intégration des données - Bruno Kieffer
10:30 : Pause
11h00 : How scarce sequence elements control the function of single β-thymosin/WH2 intrinsically disordered domains in actin assembly - Carine van Heijenoort
11h45 : Towards the characterization of the plasticity of a Retinoic Acid nuclear Receptor heterodimer complexes involving an IDP - Nathalie Sibille
12h45 : Déjeuner
Après-midi:
14h00 : Ateliers sur projets: Points à approfondir (questions théoriques, ou pratiques) présentés en fin de TP. Par exemple: calcul structure RMN , construction cristallo, microscopie électronique,...
16h00 : Pause
16h15 : Ateliers sur projets (suite)
17h30: Discussion générale, Debriefing, Questionnaire de retour des participants
19h30 : Buffet dînatoire
21h: Soirée dansante ...
Vendredi 27 mai
9h00 : Départ vers la Rochelle en Bus. (Trajet 1h15 pour la gare de La Rochelle Ville)