Programme Ecole RéNaFoBiS Oléron Juin 2015

Vendredi 5 Juin

17h30 : Bus depuis la gare de La Rochelle Ville  (Trajet 1h15 vers La vieille Perrotine)

19h30 : Repas

20h45 : Introduction et présentation générale.  Jean Cavarelli 

21h : Présentation des étudiants et des formateurs (Une diapo par personne : mon profil, mes questions biologiques)


Samedi 6 Juin

Matin : Spécificité et Complémentarité des méthodes de la biologie structurale. Illustration sur des exemples.

 9h: Topoisomérases de type II - Claudine Mayer

10h:45  Architecture des télomères - Marie-Hélène Le Du

Après-­midi : Technologies – Etat des lieux et développements

13h30-15h30: vérification de l’installation des programmes.

16h : Synchrotron et détecteurs de rayons X - Jean Luc Ferrer

17h : Cryo-microscopie électronique - Bruno Klaholz

18h : Etats des lieux et développement en RMN - Catherine Bougault

21h : Les Grandes infrastructures de biologie structurale intégrative - Jean Cavarelli.


Dimanche 7 Juin

Matin : Microscopie électronique – Aspects conceptuels

9h: Que peut-­on voir avec un microscope électronique à transmission ? - Pierre‐Damien Coureux

10h : Préparation des échantillons biologiques pour des études structurales en cryo-microscopie électronique - Guy Schoehn

11h:  Traitement d'images 2D et 3D pour l'analyse des assemblages macromoléculaires - Bruno Klaholz

Après-midi : Microscopie électronique – Aspects pratiques

14h-18h : TP / TD / Etude de cas: Pierre-Damien Coureux, Guy Schoehn, Jean François Ménetret, Bruno Klaholz.

Cryo-microscopie : reconstruction 3D, segmentation, recalage

21h: Recent advances in correlative microscopy - Kay Grünewald


Lundi 8 juin

Matin : Diffraction et diffusion – Aspects conceptuels

9h : Principes de la diffraction des rayons X par les macromolécules - Dominique Housset

9h45: Aspects pratiques de la cristallographie aux rayons X des macromolécules - Patrice Gouet

10h45: Bases de la diffusion des rayons X aux petits angles - Pierre Roblin

11h30: SAXS versus Cristallographie: informations et limites comparées - Marie-Hélène Le Du

Après-­midi : Diffraction et diffusion – Aspects pratiques

14h-18h : TP / TD / Etudes de cas - Marie-Hélène Le Du, Pierre Roblin, Dominique Housset, Jean-Luc Ferrer, Claudine Mayer, Patrice Gouet

21h : Conférence invitée: XFEL, nanocristallographie aux rayons X et molécule unique - Martin Weik


Mardi 9 juin

Matin : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects conceptuels

9h : Les observables RMN: Une source d’informations structurales et dynamiques pour les biomacromolécules - Bruno Kieffer

10h30 : Contributions de la RMN à la biologie structurale: Approches multi‐échelles spatiales et temporelles - Nathalie Sibille

Après-­midi : libre et/ou activités diverses

Soir: repas amélioré


Mercredi 10 juin

Matin : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects pratiques

9h-12h : TP / TD / Etudes de cas: Le spectre 15N HSQC pour la caractérisation rapide et simple de la structure/dynamique de biomacromolécules - Ewen Lescop, Bruno Kieffer, Catherine Bougault, Nathalie Sibille

Après midi : Résonance Magnétique Nucléaire – Aspects pratiques (suite)

14h-15h : TP / TD / Etudes de cas: Le spectre 15N HSQC pour la caractérisation rapide et simple de la structure/dynamique de biomacromolécules - Ewen Lescop, Bruno Kieffer, Catherine Bougault, Nathalie Sibille

15h-18h: Ateliers sur projets: Points à approfondir (questions théoriques, ou pratiques) présentés en fin de TP. Par exemple: calcul structure RMN , construction cristallo, microscopie électronique,...

21h : Conférence invitée: Application de la RMN du solide à la détermination structurale d’assemblages macromoléculaires, et son apport à la biologie structurale intégrative - Antoine Loquet


Jeudi 11 juin

Matin : Approches complémentaires

9h : Préparation et caractérisation des échantillons biologiques en vue d’études structurales - Marc Ruff

10h30 : Approches complémentaires pour l'analyse des interactions moléculaires. Illustrations sur plusieurs systèmes biologiques - Alain Roussel

Après-­midi : Approches complémentaires

14h : Méthodes d’imageries biologiques par microscopie à force atomique et optique - Frédéric Eghiaian

15h30 : Intégration des contraintes expérimentales pour la modélisation - Ewen Lescop

16h30: Discussion générale, Débriefing, Questionnaire de retour des participants

21h: Soirée dansante


Vendredi 12 juin

9h00 : Départ vers la Rochelle en Bus. (Trajet 1h15 pour la gare de La Rochelle Ville)